Fue construido hacia la década de 1630 mientras era gobernador Francisco de Murga, continuando hacia el sur la obra comenzada por Cristóbal de Roda tres décadas antes. Inicialmente llamado baluarte de los Cestones por los grandes cestos empleados en la construcción de sus cimientos, cambió su nombre por el del santo jesuita debido a la cercanía del colegio de la Compañía.
La disputa con los religiosos y los daños sufridos durante el asedio de De Pointis, hicieron necesaria su reconstrucción y la modificación de su traza. Juan de Herrera y Sotomayor fue el encargado entre 1720 y 1730, de proporcionarle sus características actuales, una irregular planta con garitón barroco, una rampa de acceso y un amplio solado.
